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基因組

  • 此文檔是遺傳算法原理加源代碼。 生物的進(jìn)化是一個(gè)奇妙的優(yōu)化過(guò)程

    此文檔是遺傳算法原理加源代碼。 生物的進(jìn)化是一個(gè)奇妙的優(yōu)化過(guò)程,它通過(guò)選擇淘汰,突然變異,基因遺傳等規(guī)律產(chǎn)生適應(yīng)環(huán)境變化的優(yōu)良物種。遺傳算法是根據(jù)生物進(jìn)化思想而啟發(fā)得出的一種全局優(yōu)化算法。

    標(biāo)簽: 文檔 算法原理 源代碼 過(guò)程

    上傳時(shí)間: 2014-11-17

    上傳用戶(hù):ardager

  • 下面的源代碼是解決車(chē)輛路徑問(wèn)題的。談一點(diǎn)經(jīng)驗(yàn)性的東西

    下面的源代碼是解決車(chē)輛路徑問(wèn)題的。談一點(diǎn)經(jīng)驗(yàn)性的東西,就是在進(jìn)行染色體交叉時(shí),一定要注意基因結(jié)構(gòu)的問(wèn)題。

    標(biāo)簽: 源代碼 車(chē)輛路徑問(wèn)題 經(jīng)驗(yàn)

    上傳時(shí)間: 2017-08-10

    上傳用戶(hù):moshushi0009

  • 完整的仿真源程序

    完整的仿真源程序,完整的基因遺傳仿真代碼

    標(biāo)簽: 仿真 源程序

    上傳時(shí)間: 2017-08-11

    上傳用戶(hù):firstbyte

  • 說(shuō)明JSP平臺(tái)、開(kāi)發(fā)環(huán)境

    說(shuō)明JSP平臺(tái)、開(kāi)發(fā)環(huán)境,以及相關(guān)組成元件,讓讀者完整了解它的來(lái)龍去脈、發(fā)展工具與該平臺(tái)/程式語(yǔ)言/執(zhí)行環(huán)境的特性

    標(biāo)簽: JSP

    上傳時(shí)間: 2014-06-15

    上傳用戶(hù):集美慧

  • 計(jì)算科學(xué)引論的一些算法和課件

    計(jì)算科學(xué)引論的一些算法和課件,包含基因算法和人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)

    標(biāo)簽: 計(jì)算 算法

    上傳時(shí)間: 2017-09-09

    上傳用戶(hù):lgnf

  • 流形學(xué)習(xí)算法LTSA的線性化方法

    流形學(xué)習(xí)算法LTSA的線性化方法,在基因分類(lèi)聚類(lèi)中得到了應(yīng)用,可以將新樣本線性地投射到低維空間。

    標(biāo)簽: LTSA 流形學(xué)習(xí) 算法 線性

    上傳時(shí)間: 2014-01-15

    上傳用戶(hù):ddddddos

  • 樂(lè)透選號(hào)小程式

    樂(lè)透選號(hào)小程式,分為人工選號(hào)以及電腦選號(hào),可自選所要的組數(shù),並加入氣泡排序以及不重複出現(xiàn)的功能,最後可得到所中的號(hào)碼,有需要作相關(guān)的人可以下載並照自已的需求修改

    標(biāo)簽: 程式

    上傳時(shí)間: 2013-12-23

    上傳用戶(hù):z754970244

  • 遺傳算法的MATLAB代碼

    遺傳算法為群體優(yōu)化算法,也就是從多個(gè)初始解開(kāi)始進(jìn)行優(yōu)化,每個(gè)解稱(chēng)為一個(gè)染色體,各染色體之間通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)、合作、單獨(dú)變異,不斷進(jìn)化。 優(yōu)化時(shí)先要將實(shí)際問(wèn)題轉(zhuǎn)換到遺傳空間,就是把實(shí)際問(wèn)題的解用染色體表示,稱(chēng)為編碼,反過(guò)程為解碼,因?yàn)閮?yōu)化后要進(jìn)行評(píng)價(jià),所以要返回問(wèn)題空間,故要進(jìn)行解碼。SGA采用二進(jìn)制編碼,染色體就是二進(jìn)制位串,每一位可稱(chēng)為一個(gè)基因;解碼時(shí)應(yīng)注意將染色體解碼到問(wèn)題可行域內(nèi)。 遺傳算法模擬“適者生存,優(yōu)勝劣汰”的進(jìn)化機(jī)制,染色體適應(yīng)生存環(huán)境的能力用適應(yīng)度函數(shù)衡量。對(duì)于優(yōu)化問(wèn)題,適應(yīng)度函數(shù)由目標(biāo)函數(shù)變換而來(lái)。一般遺傳算法求解最大值問(wèn)題,如果是最小值問(wèn)題,則通過(guò)取倒數(shù)或者加負(fù)號(hào)處理。SGA要求適應(yīng)度函數(shù)>0,對(duì)于<0的問(wèn)題,要通過(guò)加一個(gè)足夠大的正數(shù)來(lái)解決。這樣,適應(yīng)度函數(shù)值大的染色體生存能力強(qiáng)。 遺傳算法有三個(gè)進(jìn)化算子:選擇(復(fù)制)、交叉和變異。 SGA中,選擇采用輪盤(pán)賭方法,也就是將染色體分布在一個(gè)圓盤(pán)上,每個(gè)染色體占據(jù)一定的扇形區(qū)域,扇形區(qū)域的面積大小和染色體的適應(yīng)度大小成正比。如果輪盤(pán)中心裝一個(gè)可以轉(zhuǎn)動(dòng)的指針的話(huà),旋轉(zhuǎn)指針,指針停下來(lái)時(shí)會(huì)指向某一個(gè)區(qū)域,則該區(qū)域?qū)?yīng)的染色體被選中。顯然適應(yīng)度高的染色體由于所占的扇形區(qū)域大,因此被選中的幾率高,可能被選中多次,而適應(yīng)度低的可能一次也選不中,從而被淘汰。算法實(shí)現(xiàn)時(shí)采用隨機(jī)數(shù)方法,先將每個(gè)染色體的適應(yīng)度除以所有染色體適應(yīng)度的和,再累加,使他們根據(jù)適應(yīng)度的大小分布于0-1之間,適應(yīng)度大的占的區(qū)域大,然后隨機(jī)生成一個(gè)0-1之間的隨機(jī)數(shù),隨機(jī)數(shù)落到哪個(gè)區(qū)域,對(duì)應(yīng)的染色體就被選中。重復(fù)操作,選出群體規(guī)模規(guī)定數(shù)目的染色體。這個(gè)操作就是“優(yōu)勝劣汰,適者生存”,但沒(méi)有產(chǎn)生新個(gè)體。 交叉模擬有性繁殖,由兩個(gè)染色體共同作用產(chǎn)生后代,SGA采用單點(diǎn)交叉。由于SGA為二進(jìn)制編碼,所以染色體為二進(jìn)制位串,隨機(jī)生成一個(gè)小于位串長(zhǎng)度的隨機(jī)整數(shù),交換兩個(gè)染色體該點(diǎn)后的那部分位串。參與交叉的染色體是輪盤(pán)賭選出來(lái)的個(gè)體,并且還要根據(jù)選擇概率來(lái)確定是否進(jìn)行交叉(生成0-1之間隨機(jī)數(shù),看隨機(jī)數(shù)是否小于規(guī)定的交叉概率),否則直接進(jìn)入變異操作。這個(gè)操作是產(chǎn)生新個(gè)體的主要方法,不過(guò)基因都來(lái)自父輩個(gè)體。 變異采用位點(diǎn)變異,對(duì)于二進(jìn)制位串,0變?yōu)?,1變?yōu)?就是變異。采用概率確定變異位,對(duì)每一位生成一個(gè)0-1之間的隨機(jī)數(shù),看是否小于規(guī)定的變異概率,小于的變異,否則保持原狀。這個(gè)操作能夠使個(gè)體不同于父輩而具有自己獨(dú)立的特征基因,主要用于跳出局部極值。 遺傳算法認(rèn)為生物由低級(jí)到高級(jí)進(jìn)化,后代比前一代強(qiáng),但實(shí)際操作中可能有退化現(xiàn)象,所以采用最佳個(gè)體保留法,也就是曾經(jīng)出現(xiàn)的最好個(gè)體,一定要保證生存下來(lái),使后代至少不差于前一代。大致有兩種類(lèi)型,一種是把出現(xiàn)的最優(yōu)個(gè)體單獨(dú)保存,最后輸出,不影響原來(lái)的進(jìn)化過(guò)程;一種是將最優(yōu)個(gè)體保存入子群,也進(jìn)行選擇、交叉、變異,這樣能充分利用模式,但也可能導(dǎo)致過(guò)早收斂。 由于是基本遺傳算法,所以?xún)?yōu)化能力一般,解決簡(jiǎn)單問(wèn)題尚可,高維、復(fù)雜問(wèn)題就需要進(jìn)行改進(jìn)了。 下面為代碼。函數(shù)最大值為3905.9262,此時(shí)兩個(gè)參數(shù)均為-2.0480,有時(shí)會(huì)出現(xiàn)局部極值,此時(shí)一個(gè)參數(shù)為-2.0480,一個(gè)為2.0480。算法中變異概率pm=0.05,交叉概率pc=0.8。如果不采用最優(yōu)模式保留,結(jié)果會(huì)更豐富些,也就是算法最后不一定收斂于極值點(diǎn),當(dāng)然局部收斂現(xiàn)象也會(huì)有所減少,但最終尋得的解不一定是本次執(zhí)行中曾找到過(guò)的最好解。

    標(biāo)簽: 遺傳算法

    上傳時(shí)間: 2015-06-04

    上傳用戶(hù):芃溱溱123

  • c語(yǔ)言教學(xué)手冊(cè)9-23解答

    這個(gè)程式可以求出字串佔(zhàn)了幾個(gè)位元組 歡迎多加使用

    標(biāo)簽: 23 手冊(cè)

    上傳時(shí)間: 2016-06-15

    上傳用戶(hù):aa111

  • 跌蕩一百年

    敘述1870~1937年間中國(guó)企業(yè)的變革。作者希望從歷史中找到答案:當(dāng)今中國(guó)企業(yè)家的成長(zhǎng)基因及精神素質(zhì)是怎么形成的?它是三十年的產(chǎn)物,還是應(yīng)該放在一個(gè)更為悠長(zhǎng)的歷史寬度中進(jìn)行審視?在三十年乃至百年的中國(guó)進(jìn)步史上,企業(yè)家階層到底扮演了一個(gè)怎樣的角色? 從曾國(guó)藩、李鴻章、盛宣懷、鄭觀應(yīng),到張謇、榮家兄弟、孔宋家族,尋找中國(guó)商業(yè)進(jìn)步的血脈基因。 作者從一個(gè)特殊角度記錄中國(guó)企業(yè)的發(fā)展歷史,既有文獻(xiàn)價(jià)值,又有生動(dòng)故事…

    標(biāo)簽: 小說(shuō)

    上傳時(shí)間: 2016-11-17

    上傳用戶(hù):adam0117

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